Aunque fue diseñado en 1967 para ser la sede del Instituto de Educación de Paraná, el edificio principal que actualmente alberga el MON comenzó a ser utilizado como sede de algunas secretarías de Estado tan pronto como se inauguró en la década de 1970. En el año 2000, se iniciaron las negociaciones para transformar el espacio en un museo de arte, bajo la gestión del entonces gobernador Jaime Lerner.